Predicția statusului pacientului - Simulare OJIA 2

🏥 Problema: Analiza și predicția stării pacientului

Pentru această problemă trebuie să implementați un model de învățare automată pentru a prezice valoarea câmpului Status utilizând un set de date disponibil, care conține informații despre pacienți. Setul de date este organizat într-un fișier CSV care include diverse trăsături (features), iar evaluarea modelului se va face pe baza preciziei pentru clasa Dead.

📊 Setul de date

Setul de date conține următoarele câmpuri:

• Age: Vârsta pacientului.
• Race: Rasa pacientului (ex: White, Other).
• Marital Status: Starea civilă a pacientului.
• T Stage: Stadiul tumorii (T1, T2, T3, T4).
• N Stage: Gradul de afectare a ganglionilor limfatici.
• 6th Stage: Stadiul cancerului conform clasificării TNM a celei de-a 6-a ediții.
• differentiate: Gradul de diferențiere tumorală.
• Grade: Gradul histologic al tumorii (1, 2, 3 etc.).
• A Stage: Clasificarea stadiului bolii.
• Tumor Size: Dimensiunea tumorii.
• BMI: Indicele de masă corporală.
• Heart Rate: Ritmul cardiac.
• Serum Creatinine: Nivelul seric de creatinină.
• Uric Acid: Nivelul acidului uric.
• Hemoglobin: Concentrația hemoglobinei.
• GFR (Glomerular Filtration Rate): Rata de filtrare glomerulară.
• Serum Sodium: Concentrația de sodiu seric.
• Serum Potassium: Concentrația de potasiu seric.
• Serum Albumin: Nivelul albuminei serice.
• Lactate: Concentrația lactatului.
• Status: Starea pacientului („Dead” sau „Alive”) – câmpul țintă.

📝 Task-uri

Pentru primele subtasks, va trebui să încărcați setul de date și să efectuați analize statistice pe train.csv.

Subtask 1 (10 puncte)

Clasificați funcția renală pentru fiecare pacient pe baza valorii GFR:

• Normal dacă GFR >= 90
• Mildly Decreased dacă 60 <= GFR < 90

Subtask 2 (10 puncte)

Calculați cuartilele valorilor din coloana Serum Creatinine (Q1, Q2, Q3) și clasificați pacienții în test:

• Very Low dacă Serum Creatinine <= Q1
• Low dacă Q1 < Serum Creatinine <= Q2
• High dacă Q2 < Serum Creatinine <= Q3
• Very High dacă Serum Creatinine > Q3

Subtask 3 (10 puncte)

Determinarea valorii BMI:

• 1 dacă BMI > mediana din train
• 0 dacă BMI <= mediana

Subtask 4 (10 puncte)

Numărul de pacienți din train care se află în același T Stage ca pacientul din test.

Subtask 5 (60 puncte)

Construiți un model de ML pentru a prezice Status (Dead sau Alive) în funcție de trăsături. Evaluarea se face pe baza preciziei pentru clasa Dead.

🧮 Evaluare

Metrica de evaluare este precizia pentru clasa Dead:

unde:

• TP = numărul de pacienți corect prezis Dead
• FP = numărul de pacienți prezis Dead incorect

Formatul fișierului de submisie

Fișierul de submisie trebuie să fie în format CSV (Comma-Separated Values), cu următoarele coloane:

• subtaskID - indicele task-ului pentru care furnizăm răspunsul
• datapointID - identificatorul unic al pacientului din setul de date
• answer - răspunsul asociat pacientului din setul de date pentru task-ul indicat

Exemplu:

1subtaskID,datapointID,answer21,3220,Normal32,3220,Very High43,3220,054,3220,128165,3220,1

📌 Note

• Câmpul țintă este Status.
• Unele câmpuri pot conține valori lipsă (NaN) și trebuie tratate.
• Se recomandă analiza corelației dintre variabile și variabila țintă.
• Detectați și eliminați valori extreme dacă afectează performanța modelului.
• Trimiterea unui sample_output pentru testare locală oferă 5 puncte.

🗂️ Resurse utile

• Starter Kit complet – conține un schelet de la care puteți porni rezolvarea problemei